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Prof. Dr. A. Trkola : Traquer les variantes de virus

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Prof. Dr. A. Trkola : Traquer les variantes de virus

Alexandra Trkola est directrice de l'Institut de virologie médicale de l'Université de Zurich et s'occupe principalement des diagnostics liés aux coronavirus.

À cette fin, Mme Trkola et son équipe effectuent des tests pour détecter l'infection par le virus. Les chercheurs ont développé ces tests eux-mêmes dans leur laboratoire et les ont utilisés avec succès au début de la pandémie. Leur test d'anticorps permet de savoir si une infection par le Covid-19 a déclenché une réponse immunitaire dans l'organisme. Dans leurs études, les chercheurs examinent en détail la réponse des anticorps et soutiennent ainsi également le développement de nouveaux vaccins. Un bon vaccin doit déclencher une réponse immunitaire protectrice aussi longtemps que possible. Pour le vérifier, les sérums sanguins des personnes infectées et des personnes guéries sont examinés pour détecter la présence de différents types d'immunoglobulines (IgA, IgG, IgM) dans des séries chronologiques. Cela permet de savoir si la réponse immunitaire s'affaiblit avec le temps et si les personnes qui ont eu des symptômes graves de la maladie ont acquis une protection plus durable.

Mme Trkola et son équipe ont également mis au point un test salivaire rapide et fiable pour détecter la maladie de Covid-19. Le test rapide a maintenant été approuvé et est utilisé comme test de masse dans les écoles et les maisons de retraite.

Outre les tests d'anticorps et le développement d'un test rapide, Mme Trkola et son équipe effectuent également des tests PCR. Un test PCR amplifie des parties du virus, s'il est présent, dans un échantillon et peut détecter une infection par le SRAS-CoV-2. Aujourd'hui, Mme Trkola et son équipe se concentrent de plus en plus sur la détection des variantes virales. Il s'agit de virus qui ont muté, c'est-à-dire qui ont modifié des parties de leur matériel génétique au fil du temps. Les variantes les plus connues du virus SRAS-Cov-2 sont la variante britannique B.1.1.7, la variante brésilienne P1, la variante sud-africaine B.1.351 ou la variante indienne B.1.617. Les virus mutés présentent plusieurs modifications dans leur génome, bien que toutes les modifications ne soient pas dangereuses pour l'homme. La variante britannique, par exemple, présente 17 altérations génétiques. Cependant, la mutation dite N501Y est critique car elle assure l'échange d'un acide aminé dans la protéine de l'épi : Au lieu d'une asparagine (N), c'est une tyrosine (Y) qui s'y trouve maintenant. Il est très probable que cela augmente le contact du virus avec la cellule. Mais pourquoi ces mutations se produisent-elles ? Cela est dû à l'évolution. Les mutations qui présentent un avantage sont plus susceptibles d'être héritées. Un exemple bien connu chez l'homme est la tolérance au lactose des Européens et des Nord-Asiatiques, qui s'explique par la descendance des éleveurs de bétail et qui ne s'est apparemment établie dans les populations qu'il y a quelques milliers d'années. Les pressions évolutives font en sorte que, parmi les nombreuses variantes qui apparaissent au cours de la reproduction, celles qui se propagent particulièrement bien ou qui contournent la réponse immunitaire en bénéficient.

Si Mme Trkola et son équipe trouvent une mutation suspecte, elles en informent le médecin cantonal responsable et la signalent à l'Office fédéral de la santé publique (OFSP). La recherche des contacts devient alors active afin de trouver d'autres personnes qui pourraient avoir été infectées par la variante mutée. Leurs échantillons sont également séquencés et testés pour détecter des variantes virales. La formation de variantes virales est liée à la quantité de virus qui circule parmi les gens. L'objectif reste donc de réduire le plus possible et le plus rapidement possible le nombre de nouvelles maladies émergentes.

Prof. Dr. Alexandra Trkola, Universität Zürich

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Holger Moch, Directeur de l’institut d’anatomie pathologique et de pathologie moléculaire, hôpital universitaire de Zurich

Professeure Silvia Arber, Biozentrum de l’Université de Bâle & Institut Friedrich Miescher pour la recherche biomédicale à Bâle

Prof. Dr Jacob Corn, Institute for Molecular Health Sciences, EPF Zurich

Prof. Dr Douglas Hanahan, Laboratory of Translational Oncology, Hanahan Lab

Prof. Andrea Ablasser, Institut d’infectiologie et de santé globale, EPFL

Professeure Federica Sallusto, Institut de recherche en biomédecine, Université de la Suisse italienne, Bellinzone et Institut de microbiologie, EPF Zurich

Professeur Lukas Sommer, Institut d’anatomie, Université de Zurich

Prof. Andreas Plückthun, Institut de biochimie, Université de Zürich

Prof Michele De Palma, Swiss Institute for Experimental Cancer Research (ISREC), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)

Prof. Niko Beerenwinkel, Department of Biosystems Science and Engineering, EPF Zurich

Prof. Emmanouil T. Dermitzakis, Département de médecine génétique et développement, Faculté de médecine, Université de Genève

Prof. Dr. Paola Picotti, Institut de biologie systémique moléculaire, ETH Zurich

Professeur Wilhelm Gruissem, Institut de biologie moléculaire végétale de l’EPF de Zurich

Prof. Stylianos E. Antonarakis, Faculté de médecine, Université de Genève

Bart Deplancke, laboratoire de biologie systémique et de génétique à l’Institut interfacultaire de bioingérierie, EPF Lausanne

Prof. Nenad Ban, Institut de biologie moléculaire et de biophysique, EPF Zurich

Prof. Vincent Dion, Center for Integrative Genomics, Université de Lausanne

Prof. Dr. Gerald Schwank, Institute for Molecular Health Sciences, EPF Zurich

Prof. Timm Schroeder, D-BSSE, EPF Zurich

Prof. Dr Johan Auwerx, Laboratory of Integrative Systems Physiology LISP, EPFL

Professeur Martin Jinek, Institut de biochimie, Université de Zurich

Prof. Dr. Matthias Lütolf, Institute of Bioengineering, EPFL

Professeure Barbara Rothen-Rutishauser, Institut Adolphe Merkle, Université de Fribourg

Prof. Didier Trono, Laboratory of virology and genetics, EPFL

Dario Neri, Institut des sciences pharmaceutiques, EPFZ (Zurich)

Prof. Dr Michael Hall, département Biozentrum, université de Bâle

Mihaela Zavolan, professeure à Biozentrum, université de Bâle

Le Prof. Dr méd. Adriano Aguzzi, directeur de l’Institut de neuropathologie, Hôpital universitaire de Zurich

Prof. Dr Vassily Hatzimanikatis, Laboratoire de biotechnologie computationnelle des systèmes, EPFL

Prof. Dr. Dr. Hans-Uwe Simon, Institut de Pharmacologie de l’Université de Berne

Prof. Isabelle Mansuy, Faculté de Médecine, Université de Zürich et Département des Sciences et Technologies de la Santé, Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich (EPFZ)

Prof. Dr. Michael Detmar, Institut des sciences pharmaceutiques, Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich (ETH)

Prof. Dr. Renato Paro, D-BSSE, Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich et Faculté des sciences, Université de Bâle

Prof. Dr. Ruedi Aebersold, Institut für Molekulare Systembiologie, ETH und Universität Zürich

Effy Vayena, Institut d’éthique biomédicale, Université de Zurich

Prof. Dr. Martin Fussenegger, Department of Biosystems Science and Engineering (D-BSSE), ETH Zurich à Bâle

Prof. Dr. Viola Vogel, D-HEST, laboratoire de mécano-biologie appliquée, ETH Zurich

Prof Dr. Dirk Schübeler, Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Bâle

Prof. Denis Duboule, Département de Génétique & Evolution, Université de Genève & Institut Suisse de Recherche Expérimentale sur le Cancer, EPFL

Prof. Dr. Julia Vorholt, Département de microbiologie, Ecole Polytechnique Fédérale de Zurich

Prof. Dr. Richard Benton, Centre Intégratif de Génomique, Université de Lausanne

Prof. Dr. Richard Smith, Institute of Plant Sciences de l’Université de Berne

Prof. Dr. Susan M. Gasser, Directrice de l’Institut Friedrich Miescher à Bâle